Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retreg3Q9CQV4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retreg3Q9CQV4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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