Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim8Q9CQQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms