Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed6Q9CQG0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms