Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rpl39lQ9CQD0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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