Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med21Q9CQ39 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms