Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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