Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms