Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf8Q99PV0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms