Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms