Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms