Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms