Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrrtQ99MR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms