Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms