Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp1b1Q99LU0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp1b1Q99LU0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms