Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nus1Q99LJ8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nus1Q99LJ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nus1Q99LJ8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms