Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms