Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clp1Q99LI9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clp1Q99LI9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms