Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmd3Q99L48 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmd3Q99L48 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms