Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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