Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk9Q99J95 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk9Q99J95 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms