Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smim11aQ99J19 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim11aQ99J19 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smim11aQ99J19 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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