Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctu1Q99J10 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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