Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf144aQ925F3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms