Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms