Protein–RNA interactions for Protein: Q923B1

Dbr1, Lariat debranching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbr1Q923B1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dbr1Q923B1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dbr1Q923B1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms