Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpf3Q922U1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms