Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubb6Q922F4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms