Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi2Q920Q6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms