Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms