Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pde6cQ91ZQ1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde6cQ91ZQ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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