Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms