Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms