Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec16bQ91XT4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms