Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms