Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms