Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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