Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8VDP2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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