Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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