Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4Q8VCH8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms