Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef3Q8VCC8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms