Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms