Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpsap2Q8R574 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms