Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClmpQ8R373 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClmpQ8R373 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms