Protein–RNA interactions for Protein: Q8R285

Vmn1r79, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r79Q8R285 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r79Q8R285 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms