Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf183Q8QZS5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf183Q8QZS5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf183Q8QZS5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf183Q8QZS5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf183Q8QZS5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf183Q8QZS5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf183Q8QZS5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rnf183Q8QZS5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf183Q8QZS5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf183Q8QZS5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf183Q8QZS5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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