Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mkl1Q8K4J6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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