Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms