Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssh3Q8K330 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssh3Q8K330 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssh3Q8K330 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ssh3Q8K330 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms