Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx52Q8K301 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms