Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms